Тъй като обработването с ултразвук може потенциално да разгради протеините и да денатурира протеинови епитопи, по-нататък оценихме въздействието на ултразвуковата обработка върху целостта на протеина.
Може ли ултразвуковата обработка да увреди протеините?
Популярни отговори (1)
Стандартен протокол за ултразвук по-скоро не може да причини фрагментация на протеин- енергията е твърде ниска. Дори не трябва да причинява денатурацията му. Може да се денатурира, когато го обработите с ултразвук твърде дълго и прегреете пробата. Ако използвате никелова хроматография, други ленти може да са просто примеси.
Може ли ултразвуковата обработка да разруши пептидните връзки?
Обработката с ултразвук обикновено не може да разруши първичната структура напротеин, тъй като тази структура (последователността на аминокиселините) е изградена от ковалентни връзки, които са много пъти по-силни от водородните връзки и ултразвуковата обработка може осигурете енергията, необходима за разрушаването на тези връзки.
Ултразвуковата обработка разрушава ли ядрената мембрана?
A кратката ултразвукова обработка с ниска енергия може да наруши плазмената мембрана, без да се счупи твърде много митохондриални или ядрени мембрани, отстъпващи в такт митохондриите.
Необходима ли е ултразвукова обработка за извличане на протеин?
Разтварянето на детергент (например SDS), което е необходимо за изолирането на мембранните протеини, води до лепило като лизат главно поради нуклеиновите киселини. Следователно в такива случаи се изисква ултразвукова обработка, за да се разрушат тези нуклеинови киселини. Sonication генерира много топлина и не е добра замного протеини.
