Обратно, повечето еукариотни ДНК лигази, заедно с ензими на археи и бактериофаги, попадат във второто подсемейство; тези ензими използват АТФ като кофактор.
Изискват ли лигазите ATP?
Обикновено се използват две ДНК лигази. … T4 лигаза изисква ATP , докато E. coli лигаза изисква NAD+ (Никотинамид аденин динуклеотид е коензим, който се състои от 2 nt, свързани чрез техните фосфатни групи). И двете катализират свързването на 5′-фосфат и 3′-OH група за образуване на фосфодиестерна връзка.
Защо лигазите се нуждаят от ATP?
Двете стъпки на реакцията на ДНК лигиране
Самата реакция на лигиране на ДНК има два основни етапа. Първо краищата на ДНК трябва да се сблъскат случайно и да останат заедно достатъчно дълго, за да може лигазата да се присъедини към тях. … За да позволи на ензима да извършва по-нататъшни реакции, AMP в активното място на ензима трябва да се попълни от АТФ.
Каква е функцията на лигазите?
ДНК лигазите играят съществена роля в поддържането на геномната цялост чрез свързване на прекъсвания във фосфодиестерния гръбнак на ДНК, които възникват по време на репликация и рекомбинация, и като последица от увреждане на ДНК и нейното ремонт. Три човешки гена, LIG1, LIG3 и LIG4 кодират АТФ-зависими ДНК лигази.
Какви са лигазите, те работят активно или пасивно?
ДНК лигазата е активна по време на репликацията, процеса на възстановяване и рекомбинация на ДНК. Намира широко приложение при ремонт на едноверижнипрекъсвания на дуплексна ДНК на живи организми, използвайки комплементарната верига на двойната спирала като шаблон, докато някои форми могат специално да поправят двойноверижни увреждания.
