Тъй като DdNTPs имат водородна молекула (-H) вместо хидроксилна група (-OH), прикрепена към 3'-C на неговата дезоксирибоза, той не може да се свърже с никакви входящи нуклеотиди. Следователно, добавяне на DdNTPs по време на репликация на ДНК може да се използва за прекратяване на реакцията на синтез.
Защо синтезът на ДНК спира, когато ddNTP се включи в растящата ДНК верига?
Ако добавеният нуклеотид е "дидеоксинуклеотид" (Фигура 6.29), 3' края на нарастващата верига вече ще има H, а не OH. Това ще предотврати добавянето на допълнителни нуклеотиди; т.е. ин витро синтезът на ДНК ще спре в този момент.
Как ddNTP прекратява синтеза на ДНК?
Когато ddNTP е включен във верига от нуклеотиди, синтезът се прекратява. Това е така, защото на молекулата ddNTP липсва 3' хидроксилна група, която е необходима за образуване на връзка със следващия нуклеотид във веригата.
Защо DdNTP прекратяват процеса на репликация?
Лабораторни методи в ензимологията: ДНК
Дидеоксинуклеотид трифосфатите лесно се включват в растящата ДНК верига, но им липсва 3′ хидроксилната група, необходима, за да позволи на веригата да продължии ефективно прекратява полимеризацията.
Защо дидеоксинуклеотидите причиняват спиране на репликацията на ДНК?
Тези ddNTPs липсват 3′-OH група, която е необходима за образуването на фосфодиестерна връзка между двенуклеотиди, което кара удължаването на ДНК веригата да спре, когато се добави ddNTP.