Пептидните връзки имат планарна, транс, конфигурация и претърпяват много малко въртене или усукване около амидната връзка, която свързва α-амино азота на една аминокиселина с карбонилния въглерод от следващото (Фигура 4-1).
Защо ротацията около пептидната връзка е забранена?
Защо е забранено въртенето около пептидната връзка и какви са последствията от липсата на ротация? Пептидната връзка има частичен символ на двойна връзка, което предотвратява въртенето. Тази липса на въртене ограничава конформациите на пептидния гръбнак и ограничава възможните структури.
Могат ли пептидните връзки да се огъват?
Тъй като гръбнакът на полипептида, държан заедно от пептидни връзки, е гъвкав (поради "въртенето около всички тези връзки"), веригата може да се огъва, усуква, и се огъват в много голямо разнообразие от триизмерни форми.
Обратими ли са пептидните връзки?
Въпреки че образуването на пептидна връзка може да бъде обърнато чрез добавяне на вода (хидролиза), амидните връзки са много стабилни във вода при неутрално pH и хидролизата на пептидните връзки в клетките също е ензимно контролиран.
Пептидните връзки имат ли насоченост?
Въпреки че геометрията на пептидната група е фиксирана, връзките от двете страни на алфа въглеродите могат да се въртят. Това позволява гъвкавост на пептидния гръбнак. … Последователността от аминокиселини в протеина има насоченост илиориентация, която се определя от функционалните групи в краищата на веригата.
