BLAST може да се използва за няколко цели. Те включват идентифициране на видове, локализиране на домейни, установяване на филогенезата, ДНК картографиране и сравнение. С използването на BLAST е възможно да идентифицирате правилно даден вид или да намерите хомоложни видове.
За какво се използват BLAST?
BLAST е компютърен алгоритъм, който е достъпен за използване онлайн на уебсайта на Националния център за биотехнологична информация (NCBI), както и на много други сайтове. BLAST може бързо да подравни и сравнява ДНК последователност на заявка с база данни от последователности, което я прави критичен инструмент в текущите геномни изследвания.
Какво е BLAST техника?
Техника BLAST е метод за разрешаване на оплаквания, разработен от Алберт Барнето . Мнемониката означава повярвайте, слушайте, извинете се, удовлетворете и благодаря (Таблица 1). 6. Тази статия описва нейната полезност при грижите за пациентите и като клинично учебно средство.
Как BLAST действа на ДНК?
Как работи BLAST? BLAST идентифицира хомоложни последователности с помощта на евристичен метод, който първоначално намира кратки съвпадения между две последователности; по този начин методът не взема предвид цялото пространство на последователността. След първоначалното съвпадение, BLAST се опитва да започне локално подравняване от тези първоначални съвпадения.
Защо BLAST е по-бърз от Fasta?
По отношение на сложността по време на изпълнение на алгоритъма, BLAST е по-бърз от FASTA като търси само по-значимите модели впоследователности. Чувствителността (или точността) на BLAST и FASTA има тенденция да бъде различна за последователности на нуклеинова киселина и протеин (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
