Арабинозата е петвъглеродна захар, която се среща широко в природата и може да служи като единствен източник на въглерод в много бактерии. Протеиновите продукти от три гена (araB, araA и araD) са необходими за разграждането на арабиноза в членове на семейството Enterobacteriaceae, като E. coli и S.
Какво прави арабинозата на бактериите?
По този начин, когато присъства арабиноза за включване на арабинозния оперон, GFP се произвежда и бактериите могат да флуоресцират. Без арабиноза, GFP генът не се експресира и няма флуоресценция. Така че чрез променящ състава на хранителните вещества, изследователят може да контролира кога (и дали) се появява флоресценция в трансформираните бактерии.
Каква е ролята на арабинозата в бактериалната трансформация?
Арабиноза действа като алостеричен регулатор на AraC, променяйки към кои ДНК места се свързва и как образува димер. Не забравяйте, че арабинозата е захарта, която се катаболизира от протеините на оперона AraBAD. Когато арабинозата се добави към средата, в която живее E. coli, тя се свързва плътно с AraC.
Защо се използва арабиноза?
Употреба в биологията
В синтетичната биология арабинозата често се използва като еднопосочен или обратим превключвател за протеинова експресия под Pлошопромотор в E. coli. Този превключвател може да се отмени от наличието на глюкоза или да се изключи чрез добавяне на глюкоза в културалната среда, което е форма на катаболитна репресия.
Каквлияе ли арабинозата на генната регулация и експресията в бактериите?
Когато има арабиноза, araC отпуска конфигурацията на ДНК, така че може да се случи транскрипция, но когато този въглехидрат липсва, същият протеин ограничава ДНК, за да намали способността й да се свързва с РНК полимераза.
