Чрез улавяне на хромозомна конформация?

Съдържание:

Чрез улавяне на хромозомна конформация?
Чрез улавяне на хромозомна конформация?
Anonim

Методи, базирани на улавяне на хромозомна конформация (3C) разкриват хромозомната организация в ядрото чрез определяне на физическата близост на двойки точки по протежение на хроматина. Те запазват взаимодействията на хроматина чрез кръстосано свързване, последвано от фрагментиране, лигиране и секвениране на взаимодействащи региони.

Как работи улавянето на хромозомната конформация?

Улавяне на конформация на хромозома върху чип (4C) улавя взаимодействия между един локус и всички други геномни локуси. Той включва втора стъпка на лигиране, за да се създадат самоциркуларизирани ДНК фрагменти, които се използват за извършване на обратна PCR. … На един микрочип могат да бъдат анализирани приблизително милион взаимодействия.

Какво е улавяне на хроматинова конформация?

Chromatin Conformation Capture (3C) е важна техника, използвана за изследване на структурата на хроматина, както и основа за няколко други производни техники. … Протоколът включва формалдехидно омрежване на клетки, последвано от изолиране на хроматин и смилане с рестрикционен ензим.

Как работи Hi-C секвенцията?

Подходът Hi-C разширява 3C-Seq, за да картографира контактите на хроматина в целия геном и също така се прилага за изучаване на взаимодействията на хроматина in situ. При този метод ДНК-протеиновите комплекси са омрежени с формалдехид. Пробата се фрагментира и ДНК се екстрахира, лигира и усвоява с рестрикционни ензими.

Какво е Hi-C техника?

Класическата Hi-C техника включва рестриктивно смилане на формалдехиден омрежен геном със специфични за последователността рестрикционни ензими, последвано от попълване и възстановяване на смляните краища с включване на биотин-свързани нуклеотиди. След това ремонтираните краища се лигират отново.

Препоръчано:

Интересни статии
Кога Мелиса и Крис започнаха да се срещат?
Прочетете още

Кога Мелиса и Крис започнаха да се срещат?

Дуото беше свързано за първи път през март 2017, след като бяха забелязани заедно на международното летище в Лос Анджелис. Седмица по-късно двамата потвърдиха връзката си, като показаха PDA на плажа в Мексико. Нещата станаха сериозни през февруари 2019 г.

Какво е значението на schizachyrium scoparium?
Прочетете още

Какво е значението на schizachyrium scoparium?

Определения на Schizachyrium scoparium. красива издръжлива северноамериканска трева с листа, които стават бледобронзови през есента. синоними: Andropogon scoparius, трева от метла, прерийна трева, телена трева. вид: метла трева. всяка от няколкото треви от рода Andropogon;

Защо Теси не е доволна от първата рисунка?
Прочетете още

Защо Теси не е доволна от първата рисунка?

Причината за нещастието на Теси при първото теглене на лотарията е проста: нейното семейство е изтеглило листчето с черното петно. … Тя се опитва да твърди, че първата рисунка е била несправедлива – че на съпруга й не е било дадено достатъчно време да нарисува листчето, което е искал.