Основният играч в каталитичния механизъм в сериновите протеази е каталитичната триада каталитична триада Каталитичната триада е набор от три координирани аминокиселини, които могат да бъдат намерени в активната място на някои ензими. Каталитичните триади се срещат най-често в ензимите хидролаза и трансфераза (например протеази, амидази, естерази, ацилази, липази и β-лактамази). https://en.wikipedia.org › wiki › Catalytic_triad
Каталитична триада - Wikipedia
. … Серинът има -OH група, която е в състояние да действа като нуклеофил, атакувайки карбониловия въглерод на разцепващата се пептидна връзка на субстрата.
Как действат инхибиторите на серинова протеаза?
Сериновите протеазни инхибитори, или серпини, включват семейство протеини, които противопоставят активността на сериновите протеази. … В този механизъм серпинът представя субстрат, имитираща пептидна последователност - реактивната централна верига - към неговата целева серинова протеаза.
Каква роля в механизма на реакцията на серин протеаза играе системата за реле за зареждане?
Ролята на Asp102 в каталитичната релейна система на сериновите протеази се изучава теоретично чрез изчисляване на профилите на свободната енергия на единичната реакция на протон-пренос от мутантния трипсин Asn102 и съгласувана двойна реакция на пренос на протон (т.нар. механизъм за реле на заряда) на дивия тип трипсин.
Кое от следните е пример за серинова протеаза?
Chymotrypsin: >Използва се като пример за серинова протеаза, тъй като нейната структура и механизъм са добре разбрани.
Какви са причините да се наричат серинови протеази?
Те се наричат серинови протеази по две причини:
- Те хидролизират протеини.
- Те имат съществен остатък от Ser в активното място, което е критично за катализа. Всъщност този Ser е много по-реактивен от другите серини в протеина.